Djauhari Noor dilahirkan pada 24 Juli 1955 di Bogor, Jawa Barat. Pendidikan SD hingga SMA diselesaikan di Purwokerto, Jawa Tengah. Pada tahun 1975 melanjutkan pendidikan pada Departemen Teknik Geologi, Institut Teknologi Bandung (ITB). Pendidikan pasca-sarjana dalam bidang “Applied Geomorphological and Engineering Geological Surveys” diselesaikan pada tahun 1989 dan 1992 dari International Institute for Aerospace Survey and Earth Sciences (kini dikenal sebagai Faculty of Geo-Information Science and Earth Observation, University of Twente), Enschede, The Netherlands.